根据《基本建设财务规则》（财政部令第81号）规定，基本建设项目预决算由建设单位填报。根据《政府会计准则制度解释第2号》（财会〔2019〕24号）规定，基本建设项目应当由负责编报基本建设项目预决算的单位（即建设单位）作为会计核算主体。因此，该事业单位应当作为建设单位进行会计处理。