根据《政府会计准则第3号——固定资产》（财会〔2016〕12号）及《<政府会计准则第3号——固定资产>应用指南》（财会〔2017〕4号）规定，政府会计主体应当合理确定固定资产的使用年限并按月计提折旧，折旧应当根据用途计入当期费用或者相关资产成本。固定资产折旧年限与项目执行期无直接关系，无需保持一致。如果该单位按项目进行核算，在该科研项目执行期间，该仪器设备的折旧费用应当计入该项目的业务活动费用。项目结束后，该仪器设备应当继续计提折旧，并根据用途计入当期费用或者相关资产成本。